Da dir offensichtlich eh schon klar ist, dass die Streckenlänge grundsätzlich nicht unbedingt ideal ist für einen Diesel, nähme ich an deiner Stelle dann in jedem Fall den kleineren Motor. Der 6-Zylinder verbraucht nur einfach mehr, bringt in dem Profil aber keinen zusätzlichen Fahrspaß.
Wenn möglich solltest du aber regelmäßig, so einmal im Monat, eine längere Strecke fahren, so dass die Filter eine Chance haben, sich zu regenerieren.